Das Lenkungsgremium Monitoring besteht derzeit aus sieben Mitgliedern, deren Aufgabe es ist, die Arbeit des BNN Monitorings für Obst und Gemüse und des BNN-Fokus für Trockensortiment zu gestalten. Es entscheidet über Änderungs- und Ergänzungswünsche wie z.B. zum Ablauf der Analysenaktionen, nimmt neue Teilnehmer auf und löst das BNN-Akkreditierungsverfahren der Labore aus. Es entscheidet alle damit zusammenhängenden Fragen, sofern sie nicht auf der Teilnehmerversammlung entschieden wurden. Es entscheidet zudem über die Zugangsberechtigung von Nichtteilnehmern (Kontrollstellen, Behörden, etc.) zur Datenbank.
Die Mitglieder des Lenkungsgremiums Monitoring üben ihre Tätigkeit unabhängig und frei von Weisungen aus.